Indice con riferimenti incrociati e input di file

Suppongo che tu abbia scaricato la guida epr neofiti LaTeX per l’impaziente o meglio L’Arte di scrivere con LaTeX dalla sezione Documentazione di questo sito.
E allora hai visto certamente che per fare quello che chiedi, devi semplicemente usare il pacchetto hyperref e lui fa quasi tutto da solo.
Segui con attenzione quello che gli autori hanno scritto in quella guida.

Se mi permetti un consiglio, non combinare assieme i vari capitoli ocn un main file che li importa con \input. Io uso LaTeX da più di trenta anni, e per immettere i capitoli iso l’accoppiata \includeonly e \include. Credo che sia appena accennata questa tecnica ne L’Arte, ma quel poco che c’è è sufficiente.
La differenza consiste nel fatto che se compili solo il quarto capitolo, dopo avere precedentemente compilato da soli o insieme i capitoli precedenti, tutte le informazioni come i riferimenti incrociati o la numerazione delle pagine restano corretti come se avessi compilato tutto dal frontespizio fino alla fine del capitolo quattro.
Gli autori de L’Arte prefriscono usare il metodo con \input; io preferisco usare il metodo con \includeonly e \include, riservando \input per scopi molto particolari e tutto sommato rari. Non voglio importi niente, ma prova entrambi i metodi e scegli quello che ti piace di più.