Lunghezza pagine

Ciao!
Ho impaginato la tesi con Latex e c’è un bell’apparato di note. Ogni tanto succede che le note non sono attaccate alla fine della pagina e sulle pagine affiancate si nota che la lunghezza del testo sulle singole pagine è diversa. Si tratta però di pochi millimetri.
Ho provato con l’opzione bottom del pacchetto footmisc, ma mi sembra che non cambia nulla. Nel preambolo ho messo \flushbottom
E’ normale che si comporti così o si può fare qualcosa?
Grazie!