Memoria insufficiente per tikz e utilizzo lualatex

Spike” post=68524Probabilmente trovi la soluzione a pagina 346 del manuale di pgfplots

Ciao
Fra

Ho letto il capitolo 6 del manuale e la soluzione fornita è quella di agire sul file di configurazione. Ho un po’ di timore a farlo, dato che non sono molto esperta, per cui mi ero chiesta se compilando con lualatex si potesse aggirare il problema della limitatezza di memoria senza azioni così invasive.
Altrimenti, qualcuno mi può indicare un qualche programma facile da usare che permetta di realizzare grafici di qualità a partire da lunghi file .csv?

Ho provato a cercare il file texmf.cnf sul mio mac, per modificarlo ma non sono neanche riuscita a trovarlo. 🙁
Cercandolo col finder sono riuscita a trovare solo i seguenti files
`
patch-3extract-texmf.sh.diff
patch-md5sum_texmf.diff
patch-runfiles_texmf_dvipdfm_config_config.diff
patch-runfiles_texmf_dvipdfmx_dvipdfmx.cfg.diff
patch-runfiles_texmf-dist_scripts_epspdf_epspdf.rb.diff
patch-runfiles_texmf-dist_tex_context_base_data-res.lua.diff
`
Mi può dare una mano qualcuno?
Grazie

cfiandra” post=68533Se hai dei grafici in matlab e non riesci ad importare il .csv perché non provi ad utilizzare un metodo diverso? Esiste la libreria matlab2tikz…

Ciao
Claudio

Grazie, ma purtroppo ho dei file csv provenienti da altri programmi di simulazione. Mi interessa proprio riuscire a creare dei grafici “paper quality” a partire da un generico file csv molto lungo.

Grazie. Tuttavia non riesco a completare l’operazione che mi hai indicato.
Dopo aver modificato i valori nella copia del file texmf.cnf , non mi è permesso di salvare tale file; infatti mi compare il seguente messaggio di errore

Impossibile registrare il documento “texmf.cnf” con il nome “texmf.cnf”. Non hai i permessi.

Dovrei salvare tale file, prima di digitare l’istruzione texhash da terminale, vero? Come potrei fare? Non riesco a trovare un percorso per avere i permessi.
Grazie

OldClaudio” post=68543Non conosco abbastanza lualatex, quindi quel che dico potrebbe essere una cretinata. ma nel messaggio di errore riportato nella sua terza finestra di codice non vedo niente che si riferisca alla memoria, ma trovo una protesta sul fatto che il jobname o qualcosa d’altro manca dell’estensione voluta; probabilmente il codice di conversione richiede una specificazione dell’estensione fra quelle accettabili da lualatex e quindi anche da pdflatex; oppure il comando di conversione, sia pure chiamato dall’interno di lualatex vorrebbe produrre un file di estensione ignota. Però, come dicevo, parlo solo per aver letto il messaggio di errore e non per conoscenza diretta di quello che si vuole convetire e il modo per convertirlo.

Grazie; la tua indicazione è corretta e mi permette di evitare, per ora di ricorrere ad interventi sui codici.
Ho riprovato, con i soliti comandi, ossia
`
\begin{tikzpicture}
\begin{axis}
\addplot[blue,mark=asterisk]
plot table[x index=0,
y index=2] {/Users/cl/Desktop/csv_examples/cvs_proval.csv};
\end{axis}
\end{tikzpicture}
`
con una versione ridotta del file csv. ottenendo lo stesso risultato grafico errato 😕 , ossia i punti compaiono schiacciati su una verticale, come se avesse problemi nell’identificare la prima colonna (colonna zero). Il file csv ridotto ha esattamente il seguente contenuto

`
0,2.574229496e-05,3.755920355e-06
2.161914088e-14,2.745840719e-05,5.201514542e-05
2.589551261e-14,2.788070746e-05,6.329978774e-05
3.444825606e-14,2.894634166e-05,8.965576068e-05
4.287306094e-14,3.035725262e-05,0.0001207946836
4.997075292e-14,3.18537125e-05,0.000150718044
5.737269084e-14,3.373242103e-05,0.000185088929
6.540268056e-14,3.614872071e-05,0.0002255238719
7.478977031e-14,3.947803751e-05,0.0002762733936
8.655382729e-14,4.441584311e-05,0.0003441251745
`

Questi sono i valori effettivi che mi serve rappresentare, non posso cambiarli.
Poi ho fatto un’altra prova col seguente file csv inventato

`
3.574229496e-3,4e-3,5e-3
2.895643265e-3,4e-3,5e-3
7.574229496e-3,4e-3,5e-3
8.895643265e-3,4e-3,5e-3
9.574229496e-3,4e-3,5e-3
9.895643265e-3,4e-3,1e-3
`

e tutto funziona.
Il problema è sicuramente quel e-14 che caratterizza tutti gli elementi della prima colonna del primo file .csv. Infatti, scegliendo
`
x index=1`
ottengo un grafico sensato. Solo che quella prima colonna è l’asse temporale! Non posso farne a meno per tutti i grafici da rappresentare. Ho provato a vedere sul manuale se c’è una qualche impostazione che cambi il valore minimo rappresentabile, ma non ho trovato nulla.
C’è qualche utente che abbia la soluzione?
Grazie e buonanotte

OldClaudio” post=68553Be’, è chiaro che ci vorrebbe un valore di scala dell’asse temporale, perché l’aritmetica a virgola fissa interna dei programmi tex non consente di rappresentare valori così piccoli; se il tuo range sta bene in forma lineare, nel senza che l’asse parte da zero e arriva a qualcosa in 10^{-14}, allora ti puoi arrangiare con un programmino esterno che ti cambi la scala della prima colonna, e ti rappresenti tutto in femtosecondi, invece che in secondi (femto=10^{-15}). Un qualunque programmino in basic ti può leggere il file e riscirverlo tale e quale ma con la prima colonna moltiplicata per 10^{+15}.
Altrimenti se le ascisse scorrono diverse decadi, ti conviene usare una scala logaritmica e corrispondentemente un altro programmino in basic ti legge il file e te lo riscrive con i logaritmi decimali al posto dei valori naturali.

Ricordati sempre che i numeri in virgola fissa che TeX può gestire, rappresentati in decimale, hanno solo 5 decimali dopo la virgola.

A me era sembrato, invece, che pgfplots gestisse numeri in virgola mobile. Riporto dal manuale

Normally, this should never happen ( pgfplots uses a floating point unit with data range ±10³²⁴ and performs all mappings automatically). However, there are some cases where this fails.
Some of these cases are:

1. The axis range (for example, for x) becomes relatively small. It’s no matter if you have absolutely small
ranges like [ 10 ^-17 ; 10^-16]. But if you have an axis range like [1:99999999; 2], where a lot of signicant
digits are necessary, this may be problematic.
I guess I can’t help here: you may need to prepare the data somehow before pgfplots processes it.

2. This may happen as well if you only view a very small portion of the data range.
This happens, for example, if your input data ranges from x ∈ [0; 10⁶ ], and you say xmax=10.
Consider using the restrict x to domain*=: key in such a case, where the and
should be (say) four times of your axis limits (see page 272 for details).

Ho modificato così l’esempietto ridotto, scalando l’asse temporale,
`
\begin{axis}[restrict x to domain=1e-14:9e-14]`
e funziona.
Poi sono passata al file originario. Esso contiene un range di valori fino a 50ns, dunque da e-14 a e-8. Non posso utilizzare la scala logaritmica, dato che mi serve riportare una simulazione in transitorio di un oscillatore e, anche solo con una cala semilogaritmica, distorcerei la forma d’onda. Compilando, ho in effetti il messaggio di errore di memoria limitata, per cui mi sa che non c’è scampo e devo aumentare comunque la memoria. Una volta fatto ciò, dovrò vedere se un range lineare di sei decadi venga correttamente rappresentato.
Quindi ritorno al problema di partenza di riuscire a modificare il file texmf.cnf con i giusti permessi di scrittura. Purtroppo sono un’utente mac da poco.

Se utilizzo utf8 ho errore nel riconoscimento dei caratteri da tastiera.
Comunque, ho risolto in questo modo.
1) Ho aumentato la memoria utilizzata da TeX. Per farlo, non sapendo come ottenere i privilegi da amministratore con l’interfaccia grafica, ho utilizzato il classico comando sudo da terminale;
2) La mia speranza di fare a meno di intervenire su tutti i file csv a mia disposizione è venuta meno. Mi tocca importare il csv con matlab, selezionare una porzione del grafico che intendo visualizzare, scrivere un csv ridotto che contenga solo quelle righe, disegnare grafici sulla base di quel csv ridotto con pgfplot delimitando ogni volta i limiti della tela almeno sull’asse x.
Se solo Matlab permettesse di esportare eps di qualità eviterei tutto questo spreco di tempo, perché farlo su un centinaio di csv è davvero pesante.

ansys” post=68592

Se utilizzo utf8 ho errore nel riconoscimento dei caratteri da tastiera.
Comunque, ho risolto in questo modo.
1) Ho aumentato la memoria utilizzata da TeX. Per farlo, non sapendo come ottenere i privilegi da amministratore con l’interfaccia grafica, ho utilizzato il classico comando sudo da terminale;
2) La mia speranza di fare a meno di intervenire su tutti i file csv a mia disposizione è venuta meno. Mi tocca importare il csv con matlab, selezionare una porzione del grafico che intendo visualizzare, scrivere un csv ridotto che contenga solo quelle righe, disegnare grafici sulla base di quel csv ridotto con pgfplot delimitando ogni volta i limiti della tela almeno sull’asse x.
Se solo Matlab permettesse di esportare eps di qualità eviterei tutto questo spreco di tempo, perché farlo su un centinaio di csv è davvero pesante.

A quanto ne so, Matlab permette sia di esportare in eps che in pdf, il tutto sia da command window (print -depsc o print -dpdf ) che da menù classico.
L’unico inconveniente è che viene meno la coerenza del font, che si può superare con altri metodi.

Ciao
Orlando

Sì, Orlando, lo so e, infatti, sono ancora indecisa se optare per la generazione di figure con Matlab, ma ti assicuro che, a parità di impostazioni (anche il font usato nelle immagini Matlab è modificabile), un’immagine generata con pgfplot è di qualità nettamente superiore e ciò si vede a colpo d’occhio.