Problemi di compilazione: classicthesis + TeX Live 2012

Cari utenti del forum,
ho riscontrato un problema di cui, dopo un paio di giorni di ricerche su Google e forum vari, non sono riuscito a venire a capo. Sto scrivendo la tesi magistrale usando lo stile classicthesis con i font MinionPro.
Due giorni fa ho dovuto reinstallare completamente TeX Live 2012 (uso Ubuntu 12.04). Non sono più stato in grado di compilare il sorgente, il primo errore che ottengo è:
`
(./FrontBackmatter/Dedication.tex)
! Missing \endcsname inserted.

\bx@A
l.31 …lepage\include{FrontBackmatter/Dedication}

The control sequence marked should
not appear between \csname and \endcsname.

! Undefined control sequence.
\in@ #1#2->\begingroup \def \in@@
##1#1{}\toks@ \expandafter {\in@@ #2{}{}#1…
l.31 …lepage\include{FrontBackmatter/Dedication}
`

Commentando le righe di codice in cui includo i file Dedication.tex, Contents.tex, Bibliography.tex, Acknowledgements.tex riesco a portare a termine la compilazione, ma ovviamente questo non costituisce una soluzione.
Vi allego il file classicthesis-config.tex Qualcuno ha qualche idea in proposito?
Grazie mille.

Qualche informazione in più. TeX Live 2012 è stato installato seguendo la procedura suggerita da Enrico Gregorio. Il motivo della reinstallazione completa è il seguente. Due giorni fa ho eseguito l’update della distribuzione da tlmgr. Subito dopo l’update però non riuscivo più a compilare, ottenendo i messaggi di errore riportati sopra. Per risolvere ho fatto un restore a versioni più vecchie dei pacchetti e la compilazione della tesi andava a buon fine. Purtroppo ho eseguito il restore in maniera un po’ pedestre: non riuscivo più ad installare pacchetti da tlmgr ed ho deciso di reinstallare tutto da capo. Purtroppo ho perso il log di tlmgr quindi non ho modo di capire su quale specifico pacchetto effettuare un downgrade (ammesso che sia possibile con la nuova installazione).