Problemi dopo l’aggiornamento

Salve a tutti,
ho un piccolo problema per la soluzione del quale chiedo supporto. Il mio ambiente è Mac OS X e XeLaTex.
Era già un po’ di tempo che non ricevevo aggiornamenti e dopo un breve indagine ho visto che dipendeva dalla vecchia versione di Tex Live Utility per aggiornare la quale ho dovuto reinstallare il pacchetto completo di MacTex.
Completata l’operazione ho riaperto il mio file e ho visto alcune piccole differenze ad esempio nei titolo dei capitoli e in questa scritta che mi compare in seconda pagina di copertina “serif roman.fd Serif Roman.fd Serif Roman.cfg” di cui non comprendo l’origine.
C’è però un problema che non so come affrontare: il comando \emph{} in ambiente \footnote{} non sortisce l’effetto voluto cioè i font rimangono uguali.
Mi potete dare qualche suggerimento?
Grazie e saluti.
PM

P.S. Nessun altro comando ha effetto (ad es. \textit o\slshape) mentre se cambio classe, da book a report, le istruzioni funzionano normalmente.