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1) Windows;
2) TexMaker e MikTeX 2.6;
3) Book.
Ecco un esempio di cosa succede:

Bibliografia e Indice analitico vengono aggiunti nella Parte applicativa.
Questa cosa accade anche quando si genera l’indice generale con \tableofcontents, ossia si nota una separazione spaziale maggiore tra le due parti, tra Introduzione e I Parte, mentre tra II Parte e Bibliografia c’è poco spazio.
E’ una finezza, ma se ci fosse una soluzione sarei più contento… 😉