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Siccome il template che sto utilizzando ha un file.cls dove ci sono alcune cose che non capisco ho creato un nuovo progetto con i package utilizzati nel file .cls ma si presenta il problema in ogni caso 🙁
\documentclass[twoside,a4paper,12pt,openright]{book}
\usepackage[latin1]{inputenc}
\usepackage[italian]{babel}
\pagestyle{headings}
\usepackage{fancybox}
\usepackage{float}
\usepackage{subfigure}
\usepackage{hyphenat}
questi li ho inseriti io e non dovrebbero creare alcun tipo di problema.
\setcounter{secnumdepth}{3}
\setcounter{tocdepth}{3}
Ho provato a commentare i package uno ad uno ma non ho risolto niente 🙁
Ho tolto la creazione degli indici e nel file principale includo 2 capitoli che hanno section, subsection e subsubsection.
Intanto grazie per la risposta 🙂