Problema numerazione sezioni tesi

OK scusatemi davvero tanto ieri ero nel panico totale e ne ho fatte di ogni,
vi ringrazio per la pazienza starò sicuramente più attento in futuro, allego il file Tesi.tex

`\documentclass[11pt,% % corpo del font principale
a4paper,% % carta A4
twoside,openright,% % fronte-retro
% oneside,openany,% % solo fronte
titlepage,% % frontespizio
headinclude,,footinclude,% % testatina e piede di pagina
BCOR5mm,% % rilegatura di 5 mm
cleardoublepage=empty,% % pagine vuote senza testatina e piede di pagina
tablecaptionabove,% % didascalie in cima alle tabelle
]{scrreprt} % classe report di KOMA-Script;

\usepackage[T1]{fontenc} % codifica dei font:
% NOTA BENE! richiede una distribuzione *completa* di LaTeX,
% per esempio TeXLive o MiKTeX *complete*

\usepackage[utf8]{inputenc} % codifica di input; anche [latin1] va bene
% NOTA BENE! va accordata con le preferenze dell'editor

\usepackage[english,italian]{babel} % per scrivere in italiano e in inglese;
% l'ultima lingua (l'italiano) risulta predefinita

\usepackage[suftesi]{frontespizio} % frontespizo
% per includerlo nel documento bisogna:
% 1. compilare una prima volta Tesi.tex;
% 2. compilare a parte Tesi-frn.tex, generato dalla compilazione precedente;
% 3. compilare ancora Tesi.tex.

\usepackage{indentfirst} % rientra il primo capoverso di ogni sezione

\usepackage{graphicx} % immagini

\usepackage{listings} % codici

\usepackage[font=small]{quoting} % citazioni

\usepackage{amsmath,amssymb,amsthm} % matematica

\usepackage[italian]{varioref} % riferimenti completi della pagina

\usepackage{mparhack,fixltx2e,relsize} % finezze tipografiche

\usepackage{tabularx} % tabelle di larghezza prefissata

\usepackage[style=philosophy-modern,hyperref,backref,square,natbib,backend=biber]{biblatex}
% eccellente pacchetto per la bibliografia;
% produce uno stile di citazione autore-anno;
% lo stile “numeric-comp” produce riferimenti numerici;
% NOTA BENE! bisogna che il proprio editor sia configurato per biber

\addbibresource{Bibliografia.bib} % database di biblatex

\usepackage{subfig} % sottofigure, sottotabelle

\usepackage{lipsum} % testo fittizio

\usepackage{eurosym} % simbolo dell'euro

\usepackage[eulerchapternumbers,% % numeri dei capitoli nel font Euler
subfig,% % se si usa il pacchetto subfig
beramono,% % Bera Mono come font a spaziatura fissa
eulermath,% % AMS Euler come font per la matematica
pdfspacing,% % migliora il riempimento di riga
listings,% % codici
% parts,% % da decommentare in un documento diviso in parti
]{classicthesis} % stile ClassicThesis

\usepackage{arsclassica} % modifica alcuni aspetti di ClassicThesis

\usepackage{bookmark} % segnalibri

\input{impostazioni-tesi} % file con le impostazioni personali

\begin{document}
\pagestyle{scrheadings}
\pagenumbering{roman}
%******************************************************************
% Materiale iniziale
%******************************************************************
\input{MaterialeInizialeFinale/Frontespizio}
%\input{MaterialeInizialeFinale/Colophon}
%\input{MaterialeInizialeFinale/Dedica}
\input{MaterialeInizialeFinale/Indici}
\input{MaterialeInizialeFinale/Sommario+Abstract}
%\input{MaterialeInizialeFinale/Ringraziamenti}
\input{MaterialeInizialeFinale/Introduzione}
\cleardoublepage
%******************************************************************
% Materiale principale
%******************************************************************
\pagenumbering{arabic}
\input{Capitoli/iot}
% *****************************************************************
% Materiale finale
%******************************************************************
%\input{MaterialeInizialeFinale/Bibliografia}
%\input{MaterialeInizialeFinale/Dichiarazione}
\end{document}`

ed il file inpostazioni-tesi.tex

`%*********************************************************************************
% Comandi personali
%*******************************************************
\newcommand{\myName}{Michelangelo Sorice} % autore
\newcommand{\myTitle}{Studio di soluzioni per il controllo degli accesssi in sistemi IoT} % titolo
\newcommand{\myDegree}{Tesi di laurea} % tipo di tesi
\newcommand{\myUni}{Politecnico di Bari} % universitˆ
\newcommand{\myFaculty}{Facoltà di Ingegneria} % facoltˆ
\newcommand{\myDepartment}{Dipartimento di Ingneria Informatica e Automazione} % dipartimento
\newcommand{\myProf}{Prof.~Gennaro Boggia} % relatore
\newcommand{\myOtherProf}{Ing.~Giuseppe Piro} % correlatore (se c')
\newcommand{\myLocation}{Bari} % dove
\newcommand{\myTime}{2016} % quando

%*********************************************************************************
% Impostazioni di amsmath, amssymb, amsthm
%*********************************************************************************

% comandi per gli insiemi numerici (serve il pacchetto amssymb)
\newcommand{\numberset}{\mathbb}
\newcommand{\N}{\numberset{N}}
\newcommand{\R}{\numberset{R}}

% un ambiente per i sistemi
\newenvironment{sistema}%
{\left\lbrace\begin{array}{@{}l@{}}}%
{\end{array}\right.}

% definizioni (serve il pacchetto amsthm)
\theoremstyle{definition}
\newtheorem{definizione}{Definizione}

% teoremi, leggi e decreti (serve il pacchetto amsthm)
\theoremstyle{plain}
\newtheorem{teorema}{Teorema}
\newtheorem{legge}{Legge}
\newtheorem{decreto}[legge]{Decreto}
\newtheorem{murphy}{Murphy}[section]

%*********************************************************************************
% Impostazioni di biblatex
%*********************************************************************************
\defbibheading{bibliography}{%
\cleardoublepage
\manualmark
\phantomsection
\addcontentsline{toc}{chapter}{\tocEntry{\bibname}}
\chapter*{\bibname\markboth{\spacedlowsmallcaps{\bibname}}
{\spacedlowsmallcaps{\bibname}}}}

%*********************************************************************************
% Impostazioni di listings
%*********************************************************************************
\lstset{language=[LaTeX]Tex,%C++,
keywordstyle=\color{RoyalBlue},%\bfseries,
basicstyle=\small\ttfamily,
identifierstyle=\color{NavyBlue},
commentstyle=\color{Green}\ttfamily,
stringstyle=\rmfamily,
numbers=none,%left,%
numberstyle=\scriptsize,%\tiny
stepnumber=5,
numbersep=8pt,
showstringspaces=false,
breaklines=true,
frameround=ftff,
frame=single
}

%*********************************************************************************
% Impostazioni di hyperref
%*********************************************************************************
\hypersetup{%
hyperfootnotes=false,pdfpagelabels,
%draft, % = elimina tutti i link (utile per stampe in bianco e nero)
colorlinks=true, linktocpage=true, pdfstartpage=1, pdfstartview=FitV,%
% decommenta la riga seguente per avere link in nero (per esempio per la stampa in bianco e nero)
%colorlinks=false, linktocpage=false, pdfborder={0 0 0}, pdfstartpage=1, pdfstartview=FitV,%
breaklinks=true, pdfpagemode=UseNone, pageanchor=true, pdfpagemode=UseOutlines,%
plainpages=false, bookmarksnumbered, bookmarksopen=true, bookmarksopenlevel=1,%
hypertexnames=true, pdfhighlight=/O,%nesting=true,%frenchlinks,%
urlcolor=webbrown, linkcolor=RoyalBlue, citecolor=webgreen, %pagecolor=RoyalBlue,%
%urlcolor=Black, linkcolor=Black, citecolor=Black, %pagecolor=Black,%
pdftitle={\myTitle},%
pdfauthor={\textcopyright\ \myName, \myUni, \myFaculty},%
pdfsubject={},%
pdfkeywords={},%
pdfcreator={pdfLaTeX},%
pdfproducer={LaTeX with hyperref and ClassicThesis}%
}

%*********************************************************************************
% Impostazioni di graphicx
%*********************************************************************************
\graphicspath{{Figure/}} % cartella dove sono riposte le immagini

%*********************************************************************************
% Margini ottimizzati per l'A4
%*********************************************************************************
\areaset[current]{336pt}{750pt}
\setlength{\marginparwidth}{7em}
\setlength{\marginparsep}{2em}%

%*********************************************************************************
% Impostazioni di varioref
%*********************************************************************************
\makeatletter
\vref@addto\extrasitalian{%
\def\reftextfaraway#1{a pagina~\pageref{#1}}%
}
\makeatother

%*********************************************************************************
% Altro
%*********************************************************************************

% […] 😉
\newcommand{\omissis}{[\dots\negthinspace]}

% eccezioni all'algoritmo di sillabazione
\hyphenation{Fortran ma-cro-istru-zio-ne nitro-idrossil-amminico}

% correzione di un bug di scrreprt nella numerazione delle figure
\renewcommand*{\figureformat}{%
\figurename~\thefigure%
%\autodot%
}
\renewcommand*{\tableformat}{%
\tablename~\thetable%
%\autodot%
}`

come detto non ho modificato praticamente nulla…. allego anche ai warnings che ricevo in fase di compilazione

`You've used obsolete option `tablecaptionabove'.
fixltx2e is not required with releases after 2015(fixltx2e) All fixes are now in the LaTeX kernel.
Usage of package `titlesec' together(scrreprt) with a KOMA-Script class is not recommended.
Non standard sectioning command detected(titlesec) Using default spacing and no format.
Non standard sectioning command detected(titlesec) Using default spacing and no format.
Non standard sectioning command detected(titlesec) Using default spacing and no format.
Non standard sectioning command detected(titlesec) Using default spacing and no format.
Non standard sectioning command detected(titlesec) Using default spacing and no format.
Option `hyperfootnotes' has already been used,(hyperref) setting the option has no effect
Option `pdfpagelabels' has already been used,(hyperref) setting the option has no effect
Option `hyperfootnotes' has already been used,(hyperref) setting the option has no effect
Option `pdfpagelabels' has already been used,(hyperref) setting the option has no effect
'babel/polyglossia' detected but 'csquotes' missing.
No file Tesi.bbl.
Hyper reference `cap:iot' on page vii undefined
Hyper reference `cap:oauth' on page vii undefined
Overfull \hbox (5.0951pt too wide) in paragraph
Hyper reference `cap:ioteaouth' on page viii undefined
\float@addtolists detected!(scrreprt) Implementation of \float@addtolist became(scrreprt) deprecated in KOMA-Script v3.01 2008/11/14 and(scrreprt) has been replaced by several more flexible(scrreprt) features of package `tocbasic`.
Empty bibliography
Remember to compile Tesi-frn with(frontespizio) pdflatex Tesi-frn(frontespizio) and then rerun pdflatex.
There were undefined references.
Please (re)run Biber on the file:(biblatex) Tesi(biblatex) and rerun LaTeX afterwards.`

ho sostituito kile con Tex studio e sto cercando di capire cosa non vada nella mia installazione di texlive-full che ho eseguito da terminale,
vi ringrazio ancora per la pazienza e scusatemi se dimentico di nuovo qualcosa di utile…

mi spiego megli non riesco a mettere i numeri di sezione accanto al titolo di ciascuna di esse nel corpo del pdf, mentre nell’indice queste sono normalmente numerate
ho nel pdf

1 Primocapitolo
[…]
prima sezione

accanto a prima sezione vorrei far venir fuori 1.1 tutto qui

`
\chapter{IoT e controllo degli accessi}

\lipsum[1]

\section{Caratteristiche dei dispositivi IoT}
\lipsum[2] \medskip
\begin{description}
\item[F.1] Conteggio passi;
\begin{itemize}
\item effettuare l'upload delle informazioni e consentirne una comoda visualizzazione;
\end{itemize}
\end{description}

\lipsum[3]

Tutte queste specifiche implicano necessariamente la necessità di effettuare un trade-off costi/prestazioni; limitazioni comuni ai dispositivi IoT sono:
\begin{description}
\item[Connettività limitata]
\end{description}

Di tutti questi aspetti è necessario tenere conto quando si tenta di progettare un protocollo di autenticazione per dispositivi IoT.
\bigskip

\section{Autenticazione in ambienti IoT}
\lipsum[3]
`

questo è il primo capitolo, ma non capisco cosa possa esserci che non va dato che ho usato comandi molto standard, ho già controllato la presenza di asterischi sulle sezioni ma non ve
ne sono e in quel caso comunque queste non dovrebbero comparire nell indice… in ogni caso sto procedendo ad un installazione pulita di texlive/ctan

Come avevate suggerito si trattava di una incompatibilità della mia installazione,
ho risolto con un’installazione pulita di texlive 2016, grazie mille per la pazienza e scusatemi ancora 😀