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Riguardo la bibliografia (trattandosi quasi esclusivamente di articoli scientifici), credo che per il lettore sia più comoda la numerazione progressiva, nel senso che uno va a cercare nell’elenco direttamente il riferimento [n] trovato nel testo. Con l’ordine alfabetico sarebbe difficoltoso.
Per le figure, ripensandoci, potrei usare una numerazione che include il capitolo (tipo “figura 2.3” per intenderci). In questo caso penso sarebbe bene numerare anche tabelle ed equazioni allo stesso modo (giusto?). Solo mi sembrava inutile a meno di richiamare spesso figure o tabelle “lontane”.
Ciao,
Pietro