samiel

stai facendo confusione fra la bibliografia manuale (quella che si fa con l’ambiente thebibliography)
e quella “automatica” che si fa con biblatex (e in genere oggi col suo backend biber).
elimina tutti i riferimenti a biblatex e a biber (in effetti basta cancellare la riga
`\usepackage[backend=biber,style=numeric]{biblatex}`
quindi elimina i file ausiliari e ricompila. in questo modo a me il tuo MWE
risulta perfetto. non si tratta dunque di un bug (di biblatex), come scrivi erroneamente nel titolo del tread,
ma di un tuo errore

m

PS
1. nel preambolo carichi due volte il pacchetto graphicx, elimina un caricamento
2 per i colori, usa xcolor e non il vecchio color
3. a differenza di molti in questo forum, non sono un matematico, ma credo che mathtools carichi già di suo amsmath,
per cui non serve caricare il secondo

io ho un i5 vecchio di diversi anni
e non riscontro problemi simili

m

nota un altro dettaglio tipografico, che ha portato ai font metrici.
se un font è concepito per 10 o 12 pt e tu lo riduci, li font non risulterà solo più piccolo,
ma eccessivamente sottile; se invece lo aumenti, non risulterà solo più grande,
ma eccessivamente grosso. Se infatti guardi un font metrico nelle varie dimensioni,
noterai che quello concepito per essere usato nelle piccole dimensioni
è un po’ più grosso, e quello atto a essere usato nelle grandi dimensioni
è un po’ più sottile. Ad es., con Adobe Garamond Premiere Pro avrai:
` UprightFont=*-Regular,
UprightFeatures={
SizeFeatures={
{Size={-8.4}, Font=*-Caption},
{Size={8.5-10.9}, Font=*-SmText},
{Size={11-13.9}},
{Size={14-21.4}, Font=*-Subhead},
{Size={21.5-}, Font=*-Display}
},
},`
Finezze per tipografi? Chissà…
m

La situazione è piuttosto controversa, perché ogni programma fa i calcoli a modo suo,
considerando lo scartamento o l’interlinea. Basta considerare cosa succede
usando apparentemente la stessa impostazione (scartamento aumentato a 1.5):

m

Nel roman 10 del CM il vertice del glifo del /2/ arriva a 1364pt dalla baseline
e quello della /C/ maiuscola a 1444pt. Poiché la grazia della /I/ è a 1399pt,
l’overshoot è largo da 1399 a 1444. Dunque l’altezza dei numeri è inferiore
per scelta grafica e non si muove nel range dell’overshoot

m

Come sempre, se non allegate il codice è assai arduo capire l’errore.
Avete mai provato a telefonare al medico dicendogli:
«Dottore, non mi sento bene. Cosa devo prendere?».
Ma quando dici:

ma procedendo alla semplice compilazione tramite pdfLatex

.
è palese che compili con pdflatex e non segui l’obsoleta trafila latex+dvips+ps2pdf
In ogni caso, prova a rimuovere l’opzione dvips.
Se l’errore persiste, posta il codice

m

Se vuoi reinstallare i pacchetti momentaneamente eliminati dal sistema,
ma che appartenevano all’installazione originaria, devi dare
`tlmgr update –self –all –reinstall-forcibly-removed –repository http://mirror.ctan.org/systems/texlive/tlnet`
Ovviamente, è la stringa –reinstall-forcibly-removed a fare la differenza

m